Xã Phùng Nguyên là đơn vị hành chính cấp xã thuộc Tỉnh Phú Thọ, theo bộ máy hai cấp sau sáp nhập năm 2025. Mã bưu chính (zip code) của Xã Phùng Nguyên là 35262. Mã đơn vị hành chính là 08521, diện tích 30,57 km², dân số 41.046 người, mật độ 1.343 người/km².